山东农业大学是一本，而山东大学是985院校，双一流大学，无论在山东还是全国都是知名高校。

山东农业大学在泰安，学课以农业农学见长，山东大学是综合性大学，有多个校区，千佛山校区，青岛校区，兴隆山校区等，数学，计算机等在第四轮学科评级中在全国知名。

这个问题还得综合起来看，山东大学好于山东农业大学。但是如果比较农学专业，肯定又不具备可比性，因为山东大学没有农学专业。山东大学是985.211大学，而山东农业大学是双非大学；前者没有A类学科，后者有八个A类学科；前者每年高考录取分数线远低于后者。