根据南阳市中原驾校官网提供的信息，南阳市中原驾校资格证办理流程如下：

1. 学员需要准备好相关的材料，包括身份证、毕业证书等证明身份和学历的材料。

2. 学员需要到南阳市中原驾校进行报名，缴纳相关的费用。

3. 报名后，学员需要参加理论考试和实际驾驶考试，通过考试后，即可领取驾校资格证。

需要注意的是，南阳市中原驾校的资格证办理流程可能会因为政策和规定的变化而有所不同，建议学员在具体办理前先到南阳市中原驾校官网或者咨询该驾校的相关工作人员了解最新的资格证办理流程和要求。