一是，内蒙古科技大学包头师范学院、内蒙古科技大学包头医学院受到校名以及资源分配的影响，在招生计划、硕士点建设、项目申请、对外交流等方面受到严重制约；

二是，因为三个学校一个名称，学校的办学特色难以彰显；

三是，三校一户容易使人产生误解，特别是对于用人单位而言，常常将内蒙古科技大学包头医学院以及包头师范学院当作内蒙古科技大学的二级学院，不利于学生就业以及职业发展。