秦晋崤之战中存在的矛盾主要包括：

秦与郑的矛盾 ：

秦国与郑国之间存在敌对关系，秦国试图通过战争来扩张自己的势力范围。

秦国内部的矛盾 ：

秦国内部对于是否应该出师存在分歧，一部分人支持出师，而另一部分人则反对。

秦与晋的矛盾 ：

秦国与晋国之间存在根本的战略利益冲突，两国在争夺中原地区的控制权和影响力上发生了激烈的对抗。

晋国内部的矛盾 ：

晋国内部对于是否应该攻打秦军同样存在分歧，一些大夫支持攻击秦军，而晋文公则出于大局考虑，认为攻击秦军是不仁的行为。

这些矛盾最终导致了秦晋崤之战的爆发，并影响了战后的局势发展