皖南医学院开设的专业有：金融学类的保险学专业、法学类的法学专业、心理学类的应用心理学专业、电子信息类的医学信息工程专业、其中2022年皖南医学院开设的国家特色专业有：法医学。

皖南医学院赭麓校区的专业有：信息管理与信息系统、公共事业管理、法医学、制药工程、医学影像技术、护理学、麻醉学、医学检验技术、预防医学、口腔医学、临床医学等。