南京邮电大学和哈尔滨工程大学都是我国比较著名的高校，它们的专业设置、师资力量、学科建设、科研水平等方面都有所特色。

因此，选哪个学校还需要根据个人的具体情况来综合考虑，以下是一些参考因素：

1. 专业选择：两所学校的专业设置有所不同，建议先了解两所学校的专业设置，确定自己感兴趣的专业是否在其中。同时，还需要了解两所学校在该专业方面的师资力量、教学资源等方面的情况。

2. 学校综合实力：两所学校的综合实力也是一个重要的考虑因素。可以从学校的学科建设、教学质量、科研水平等方面进行比较。

3. 就业前景：就业前景是考虑选择哪个学校的另一个重要因素，需要了解两所学校在就业方面的表现和优势，以及就业市场对该专业的需求情况。

4. 学校环境：两所学校的校园环境也需要考虑，包括校园面积、师生比例、学生活动和社团组织等方面，以及所在城市的生活环境和交通便利程度等因素。需要注意的是，以上因素仅供参考，具体选择还需要根据个人情况和需求进行综合考虑。