会计师在计算特殊佣金时，通常有以下几种方法：

按比例计算：

这是最常见的计算方法，佣金等于销售额乘以佣金比例。例如，如果佣金比例是5%，那么佣金就等于销售额的5%。

按固定金额：

有些情况下，佣金可能是固定的金额，而不是销售额的百分比。例如，每月固定的佣金费用为1000元。

按阶梯：

当销售额达到一定标准后，佣金按不同的比例计算。例如，销售额在10万元以下时，佣金比例为3%；销售额在10万元至20万元之间时，佣金比例为4%。

含佣价计算：

含佣价是指包含佣金的销售价格，佣金等于含佣价乘以佣金率。例如，如果含佣价为110元，佣金率为5%，那么佣金就是110元×5%。

净价计算：

净价是指不包含佣金的销售价格，计算公式为净价除以（1减去佣金率）。例如，如果净价为100元，佣金率为5%，那么佣金就是100元÷（1-5%）。

在会计处理佣金时，还需要注意以下几点：

佣金需要根据实际发生法和实际收入法进行计税，并考虑报销及冲销等情况。

佣金在收入确认时，可能会计入销售费用、合同取得成本或营业成本，具体取决于佣金的性质和企业的会计政策。

支付佣金时，会计分录通常为：借：销售费用，贷：银行存款。

根据以上方法，会计师可以根据具体情况和企业的会计政策选择合适的计算方法，并进行相应的会计处理。