万元版增值税专用发票的最高开票限额为 9999.99元，这是指不含税金额的最高限额。在开票时，如果选择17%的税率，则税额为1700.00元，因此万元版增值税专用发票的价税合计最高为11699.99元。

需要注意的是，尽管有些信息提到万元版专用发票的销售额最高限额为10万元，但这可能是指含税金额或特定条件下的限额，并不适用于所有情况。因此，在实际操作中，应以最新的税务规定为准，并确保遵守相关税法规定。