农业合作社需要缴纳的税种主要包括增值税、企业所得税、个人所得税、附加税等。具体如下：

增值税

销售农产品、提供农业服务时，如果产生增值额，需要缴纳增值税。

税率根据农产品种类和合作社资质有所不同。

企业所得税

根据应税收入减去成本费用后的利润总额，乘以企业所得税率计算。

个人所得税

合作社中的个人成员如果获得工资、奖金、津贴等收入，需要缴纳个人所得税。

附加税

可能包括城市维护建设税、教育费附加等。

其他可能的税种

营业税（在某些情况下可能适用）

财产税（针对固定资产、不动产等征收）

印花税（特定类型的税收，如物品背书或状态确认时缴纳）

需要注意的是，对于农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，可以视同农业生产者销售自产农业产品免征增值税。增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，也可以按一定比例计算抵扣增值税进项税额。

具体的税率和免税额度，需要根据当地政策和合作社的具体经营情况来确定。建议咨询当地税务部门或专业税务顾问获取最准确的信息