食品行业的主管部门，按现在中国的行政架构，在中央一层应是国家食品与药物管理局，部分省级行政区域也设立了对应机构管理食品行业。

再说食品行业的地方主管部门。在卫生方面，是由县级卫生防疫站主管，比如颁发卫生许可证，年审等。在质量技术方面，是由质量技术监督局主管，比如控制QS质量安全准入证的发放等。如果是出口食品生产厂，还要受到进出口商品检验局主管审核。