您的理解是对的，在2019年4月1日之前农产品加计扣除的比例是2%，4月1日起降税率后，销售农产品税率降到9%，制造业企业购进农产品用于生产税率13%货物的，计算进项税额扣除率降为10%。因此加计扣除比例随着降到1%（10%-9%）。

相关规定：

《财政部税务总局海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部税务总局海关总署公告2019年第39号）

纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。