根据财政部 税务总局 海关总署公告 2019 年第 39 号第六条的规定，纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。其中，取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，计算抵扣。

另，参考国家税务总局青岛市税务局对于改签费的相关回答可知，对取得改签以后的行程单，电子客票行程单上列明的机票改签费，属于航空运输企业提供航空运输服务取得的全部价款和价外费用的范畴，即，改签费应并入票价部分。

综上，贵司取得改签后的行程单，按照票价+燃油附加费+改签费部分，计算抵扣进项税额。

相关规定：

《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》(财政部 税务总局 海关总署公告 2019 年第 39 号)

纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。

(一)纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照

1.取得增值税电子普通发票的，为发票上注明的税额;

2.取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，为按照下列公式计算进项税额：

航空旅客运输进项税额=(票价+燃油附加费)÷(1+9%)×9%

3.取得注明旅客身份信息的铁路车票的，为按照下列公式计算的进项税额：

铁路旅客运输进项税额=票面金额÷(1+9%)×9%

4.取得注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票的，按照下列公式计算进项税额：

公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷(1+3%)×3%

企业员工出差，取得电子客票行程单，行程单中单独注明了改签费，改签费是否可以按照购进旅客运输服务计算抵扣进项税

航空运输电子客票行程单上列明的机票改签费，属于航空运输企业提供航空运输服务取得的全部价款和价外费用的范畴，可以按照《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》(财政部 税务总局 海关总署公告 2019 年第 39 号)第六条的有关规定计算抵扣进项税。