来自自然界的化学成分既包括组成生物体的化学物质，也包括生物体新陈代谢过程中的一系列产物，以及生命活动的作用物质。因此天然药物化学成分结构复杂、数量繁多。通常可根据其化学结构、生理活性、来源、生源关系和生源结合化学结构进行分类。